{"id":9580,"date":"2023-04-17T21:37:59","date_gmt":"2023-04-17T21:37:59","guid":{"rendered":"https:\/\/revistanyt.com.ar\/online\/?p=9580"},"modified":"2023-04-17T21:37:59","modified_gmt":"2023-04-17T21:37:59","slug":"infecciones-escondidas","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/revistanyt.com.ar\/online\/infecciones-escondidas\/","title":{"rendered":"Infecciones escondidas"},"content":{"rendered":"

Un equipo cient\u00edfico argentino desarroll\u00f3 un algoritmo que permite detectar con alta sensibilidad la presencia de m\u00e1s de una variante del SARS-CoV-2 coinfectando a un mismo individuo. El estudio analiz\u00f3 1097 hisopados de personas infectadas durante los primeros 18 meses de la pandemia y mostr\u00f3 que un 2% de ellas presentaban coinfecciones. El trabajo brinda una herramienta clave para comprender y predecir el comportamiento del virus en nuestra poblaci\u00f3n.<\/strong><\/span><\/p>\n

l 8 de marzo de 2020, reci\u00e9n iniciada la pandemia en Europa, una adolescente de 17 a\u00f1os se present\u00f3 en la sala de emergencias de un hospital de Portugal. Llevaba nueve d\u00edas con fiebre, ten\u00eda tos, le dol\u00eda el pecho y sufr\u00eda v\u00f3mitos. No ten\u00eda antecedentes de padecer otra patolog\u00eda, es decir, hasta entonces hab\u00eda sido una joven saludable. Sin embargo, a pesar de su juventud y de la ausencia de comorbilidades, desarroll\u00f3 la forma severa de COVID-19 y estuvo internada en dos oportunidades. Los an\u00e1lisis posteriores mostraron que hab\u00eda estado infectada simult\u00e1neamente por dos variantes del coronavirus. Fue el primer caso probado de coinfecci\u00f3n por SARS-CoV-2.<\/p>\n

La presencia de virus distintos invadiendo un mismo organismo constituye un riesgo. No solo para el individuo, por el posible agravamiento de su estado cl\u00ednico sino, tambi\u00e9n, para el resto de la poblaci\u00f3n. Porque esas variantes pueden encontrarse en el interior de una c\u00e9lula de la persona infectada e intercambiar segmentos de su material gen\u00e9tico dando lugar a la aparici\u00f3n de nuevos linajes del virus. Por eso es relevante la detecci\u00f3n de individuos portando m\u00e1s de una variante viral.<\/p>\n

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Cr\u00e9dito foto: pxhere.com<\/span><\/p><\/div>\n

No obstante, en el caso del SARS-CoV-2, la coinfecci\u00f3n sigue siendo un fen\u00f3meno que no est\u00e1 suficientemente estudiado. Una de las razones para que esto suceda tiene que ver con los m\u00e9todos que se utilizan para identificar las variantes.<\/p>\n

La presencia de virus distintos invadiendo un mismo organismo constituye un riesgo. No solo para el individuo, tambi\u00e9n para el resto de la poblaci\u00f3n.<\/p><\/blockquote>\n

Secuencias candidatas<\/strong><\/span><\/h5>\n

Desde el surgimiento del SARS-CoV-2 a finales de 2019, infinidad de laboratorios de distintas partes del mundo analizan la secuencia gen\u00e9tica de los virus que se van encontrando en los hisopados nasofar\u00edngeos. En la Argentina, esa tarea la lleva a cabo el Proyecto Argentino Interinstitucional de Gen\u00f3mica del SARS-CoV-2 (Proyecto PAIS), un consorcio financiado por el Ministerio de Ciencia, Tecnolog\u00eda e Innovaci\u00f3n que est\u00e1 conformado por decenas de investigadores de diferentes instituciones p\u00fablicas y privadas de distintos lugares de nuestro territorio.<\/p>\n

La informaci\u00f3n de esas secuencias virales est\u00e1 reunida en una base de datos de acceso p\u00fablico que, actualmente, tiene m\u00e1s de quince millones de registros. De esta manera, la Organizaci\u00f3n Mundial de la Salud puede efectuar una vigilancia en tiempo real y controlar la aparici\u00f3n de \u201cvariantes de preocupaci\u00f3n\u201d de SARS-CoV-2.<\/p>\n

Pero, como los virus tienen una frecuencia de mutaci\u00f3n significativa, es habitual que, durante el tiempo que est\u00e1n infectando a un organismo, se produzcan variantes gen\u00e9ticas virales m\u00e1s o menos diferentes entre s\u00ed. Por eso, los m\u00e9todos que se utilizan para identificar las secuencias gen\u00e9ticas de los virus presentes en una muestra se apoyan en algoritmos que analizan esas variaciones y brindan \u201csecuencias de consenso\u201d. Es decir, la (o las) secuencias gen\u00e9ticas m\u00e1s probables del (o de los) virus que est\u00e9n infectando a un individuo. Y eso es lo que se vuelca a la base de datos.<\/p>\n

Los m\u00e9todos de secuenciaci\u00f3n que se usan actualmente son muy sensibles pero fallan en la detecci\u00f3n de mutaciones puntuales que ocurren con baja frecuencia.<\/p><\/blockquote>\n

\u201cLos m\u00e9todos de secuenciaci\u00f3n que se usan actualmente son muy sensibles. Pero utilizan algoritmos que, si bien brindan una secuencia de consenso con facilidad, fallan en la detecci\u00f3n de mutaciones puntuales que ocurren con baja frecuencia\u201d, explica Ezequiel Sosa, ingeniero en sistemas que se desempe\u00f1a como personal de apoyo del CONICET en el Instituto de Qu\u00edmica Biol\u00f3gica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales de la UBA (IQUIBICEN). \u201cDe esta manera, se pasan por alto secuencias del virus que podr\u00edan ser significativas en el proceso de infecci\u00f3n\u201d, completa.<\/p>\n

Sosa es uno de los autores de un trabajo publicado en la revista cient\u00edfica Virus Research<\/em> en el que un equipo de investigadoras e investigadores argentinos describe el desarrollo y la puesta a prueba de una novedosa plataforma bioinform\u00e1tica que denominaron VICOS, por las siglas en ingl\u00e9s de \u201cvigilancia de coinfecciones virales\u201d.<\/p>\n

Su nombre refleja su principal utilidad: es una herramienta que propone secuencias gen\u00e9ticas del virus que podr\u00edan estar coinfectando a un determinado individuo. \u201cVICOS es un conjunto de algoritmos ensamblados que provee una lista de secuencias virales que son candidatas a estar causando coinfecciones\u201d, ilustra Sosa.<\/p>\n

El equipo de investigaci\u00f3n utiliz\u00f3 VICOS para evaluar 1097 muestras provenientes de hisopados nasofar\u00edngeos efectuados entre marzo de 2020 y agosto de 2021 en todo el pa\u00eds. \u201cVICOS mostr\u00f3 que 23 de esas muestras, es decir un 2%, ten\u00edan m\u00e1s de una poblaci\u00f3n viral\u201d, informa, y detalla: \u201cEl an\u00e1lisis posterior de esas 23 muestras revel\u00f3 que 3 de esos casos hab\u00edan sido coinfecciones por dos virus del mismo linaje, 2 casos hab\u00edan sido coinfecciones por virus de diferentes linajes y 13 casos eran compatibles con una coinfecci\u00f3n por dos virus y, tambi\u00e9n, con el desarrollo de una segunda variante dentro del organismo durante el proceso de infecci\u00f3n. Los 5 casos restantes de m\u00e1s de una poblaci\u00f3n viral en una misma muestra probablemente se debieron a contaminaci\u00f3n en el laboratorio\u201d.<\/p>\n

La originalidad de VICOS radica en que se trata de una herramienta inform\u00e1tica espec\u00edfica para la detecci\u00f3n de coinfecciones por SARS-CoV-2.<\/p><\/blockquote>\n

En definitiva, VICOS puso en evidencia que, con los m\u00e9todos utilizados hasta el momento en todo el mundo, esos casos de coinfecci\u00f3n hab\u00edan pasado desapercibidos.<\/p>\n

Relevancia sanitaria<\/strong><\/span><\/h5>\n

VICOS permite identificar coinfecciones o variaci\u00f3n intrapaciente de SARS-CoV-2 en miles de muestras cl\u00ednicas al mismo tiempo con una alta sensibilidad y est\u00e1 disponible como software de c\u00f3digo abierto.<\/p>\n

Desde el punto de vista cient\u00edfico, la originalidad de VICOS radica en que se trata de una herramienta inform\u00e1tica espec\u00edfica para la detecci\u00f3n de coinfecciones por SARS-CoV-2. Por otra parte, los resultados del trabajo evidencian la gran capacidad del virus para diversificarse y, tambi\u00e9n, para evolucionar dentro del organismo.<\/p>\n

Seg\u00fan los autores del estudio, \u201cque el 2% de las muestras analizadas presentaran coinfecciones muestra la necesidad de prestar m\u00e1s atenci\u00f3n a este fen\u00f3meno en la pr\u00e1ctica cl\u00ednica y en los programas de vigilancia epidemiol\u00f3gica\u201d.<\/p>\n

En este sentido, la investigadora del CONICET Mariana Viegas, responsable del Proyecto PAIS y directora del estudio, se\u00f1ala que VICOS \u201ces importante para entender la din\u00e1mica de transmisi\u00f3n del virus y para detectar con m\u00e1s precisi\u00f3n la posibilidad de que se generen variantes recombinantes por coinfecci\u00f3n, o variaciones intrapaciente en las personas persistentemente infectadas por SARS-CoV-2 que se han propuesto como generadores de las variantes de preocupaci\u00f3n, como fue el caso de Omicron\u201d.<\/p>\n

Finalmente, la investigadora resalta la importancia de efectuar este tipo de an\u00e1lisis en la Argentina: \u201cConocer en profundidad c\u00f3mo evoluciona el virus en distintos entornos inmunitarios permite predecir qu\u00e9 podr\u00eda suceder en el futuro con las variantes. En el caso de nuestro pa\u00eds, nos muestra c\u00f3mo el virus se comporta en nuestra poblaci\u00f3n con un background<\/em> de vacunas distinto a otras partes del mundo. Esto es importante, sobre todo ahora que estamos en pleno desarrollo de vacunas locales. Saber y entender bien c\u00f3mo el virus evoluciona en este contexto es muy importante para poder definir formulaciones futuras de esas vacunas locales\u201d.<\/p>\n

Autor: Gabriel Stekolschik<\/span><\/span><\/p>\n

Fuente: nexciencia<\/span><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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